同稱：「自體免疫疾病」、「自體免疫」。免疫系統的自我辨識功能發生問題，致使免疫系統針對自身的組織與器官產生異常免疫反應而引起疾病。 發生原因不明，可能與遺傳有關，也可能是某些感染性疾病所引起的併發症。 例子：紅斑性狼瘡、類風溼性關節炎等。
自體免疫紅斑性狼瘡類風溼性關節炎橋本氏甲狀腺炎胰島素依賴性糖尿病風溼熱重症肌無力玄武岩外耳大腸癌等張溶液應變變因控制變因操作變因腎孔單棲固氮莖的表皮攀木蜥蜴外來種南方猿人lux種源中心冷凍蝕刻擬態同分異構物針狀葉八目鰻傳導性耳聾無碳能源光受器