同稱：「自體免疫疾病」、「自體免疫」。免疫系統的自我辨識功能發生問題，致使免疫系統針對自身的組織與器官產生異常免疫反應而引起疾病。 發生原因不明，可能與遺傳有關，也可能是某些感染性疾病所引起的併發症。 例子：紅斑性狼瘡、類風溼性關節炎等。
自體免疫紅斑性狼瘡類風溼性關節炎橋本氏甲狀腺炎胰島素依賴性糖尿病風溼熱重症肌無力多層柱狀上皮組織同分異構物環境負荷量生態工法中耳諾貝爾生醫獎應變變因外來種種化作用顯微測量技術環境容忍度腸脂酶領先股人類基因體計畫查德撒赫爾人猿都市熱島效應花岡岩硝化作用腎孔莖的表皮動物病毒熔點偽裝