同稱：「自體免疫疾病」、「自體免疫」。免疫系統的自我辨識功能發生問題，致使免疫系統針對自身的組織與器官產生異常免疫反應而引起疾病。 發生原因不明，可能與遺傳有關，也可能是某些感染性疾病所引起的併發症。 例子：紅斑性狼瘡、類風溼性關節炎等。
類風溼性關節炎橋本氏甲狀腺炎胰島素依賴性糖尿病紅斑性狼瘡重症肌無力風溼熱生源論蘇力菌細胞內液化學醬油領先股延滯股等張溶液異域種化副甲狀腺種化作用目鏡測微器載物臺測微器大陸島嶼同功器官警戒色顯微測量技術循環式電子傳遞高血糖症原腎管C4 植物種源中心焰細胞腎口負回饋作用