- 傳統農業生態平衡的瓦解
- 1、改革開放後農民的增產，大量化肥與農藥的使用以及工業廢水排放，造成環境的壓力與汙染；過度農墾、放牧、引水灌溉等土地超限利用所導致的草原三化（沙化、鹼化、退化）、水土流失問題。此外珠江三角洲基塘農業塘基比例提高、投入飼料與農藥，造成大雨時塘基易塌而造成水患與生態失衡等問題。
- 2、因應：生態農業興起、推廣「農－林－牧」複合型生態農業模式、北方使用「四位一體」模式及西北地區採用「五配套」。
- 農工部門之間的競爭
- 1、隨著經濟發展，工業與都市占用大量耕地，導致農地縮減、城鄉收入差距擴大，造成區域發展不均。
- 2、因應：透過適當的政策與農業技術，輔導農民提高產量與收入；有效利用現有工業與都市用地，減少農地的再變更。
- 市場經濟的轉型調整問題
- 1、長期計畫經濟下，向市場經濟轉型的調適問題，在加入WTO後暴露其經營缺點：農民對市場需求與反應不夠靈敏，小農經濟特徵導致平均每人耕地面積小、農業技術與機械化程度仍低於已開發國家，導致缺乏競爭力。
- 2、因應：如何擴大生產規模，降低生產成本方能與國際市場競爭。