同稱：「自體免疫疾病」、「自體免疫」。免疫系統的自我辨識功能發生問題，致使免疫系統針對自身的組織與器官產生異常免疫反應而引起疾病。 發生原因不明，可能與遺傳有關，也可能是某些感染性疾病所引起的併發症。 例子：紅斑性狼瘡、類風溼性關節炎等。
紅斑性狼瘡類風溼性關節炎橋本氏甲狀腺炎胰島素依賴性糖尿病風溼熱重症肌無力無碳能源高血糖症外耳同位素腎孔應變變因焰細胞同功器官多層鱗狀上皮組織南方猿人脫氮作用異域種化再生資源尼安德人同分異構物外來種花岡岩負回饋作用種源中心偽裝萊爾可見光鱗葉廣適應型生物