臺灣巡撫衙門是清領時期最高行政機關，原址在今臺北市中山堂左側，臺北市警察局附近設有「清臺灣巡撫衙門舊址」石碑。 日本在西元 1915 年建成臺灣總督府後，正式漸移往總督府，西元 1932 年總督府將巡撫衙門主要建築拆除，僅保留部份布政使司衙門及欽差行臺建築。
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