- 日治初期消極防衛（西元 1895 ~ 1909 年），因日人忙於鎮壓漢人的武裝抗日，不願與原住民為敵。繼續採用劉銘傳的政策，設立隘口，僱用原住民協助砍伐樟樹。
- 西元 1910 ~ 1915 年總督佐久間左馬太擬定「五年理蕃計畫」，先收繳原住民槍枝，日本軍警再深入山林，統治原住民。將山林視為無主地，收歸國有，再撥給日商開發。
- 西元 1915 ~ 1930 年總督府設「理蕃課」，以宗教、教育、授產（精耕農業）等手段安撫原住民，並強制原住民遷徙至特定區域。設置派出所，日本警察配合政策與原住民女子通婚。