控制性狀的基因恰巧位於性染色體上，其性狀的遺傳與性別產生相關聯。若控制性狀的基因位於 X 性染色體上，因為 Y 染色體上無此等位基因存在，所以雄性只要有一個隱性基因，就可以表現出性狀，雄性患病機率大於雌性；若此基因為顯性，則雌性患病機率大於雄性。 若控制性狀的基因位於 Y 性染色體上，因為 X 染色體上無此等位基因存在，所以雄性只要有此基因，就可以表現出性狀，而且一定是父傳子，雌性不會患病，例如： 耳上生毛。
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